สำนักวิจัยและพัฒนาการเกษตร (สวพ.) จัดตั้งขึ้นตามพระราชกฤษฎีกาการแบ่งท้องที่ของกรมวิชาการเกษตร กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ ออกเป็นเขต ในปี พ.ศ. 2535 ได้ประกาศในพระราชกิจจานุเบกษาเล่มที่ 109 ตอนที่ 104 วันที่ 30 กันยายน พ.ศ.2535 โดยแบ่งเป็น 8 เขต  เขตที่ 1 และ 2 รับผิดชอบการปฏิบัติงานในพื้นที่ภาคเหนือ เขตที่ 3 และ 4 รับผิดชอบการปฏิบัติงานในพื้นที่ภาคตะวันออกเฉียงเหนือ เขตที่ 5 และ 6 รับผิดชอบการปฏืบัติงานในพื้นที่ภาคกลาง ภาคตะวันตก และภาคตะวันออก และเขตที่ 7 และ 8 รับผิดชอบการปฏิบัติงานในพื้นที่ภาคใต้
         สำนักวิจัยและพัฒนาการเกษตรที่ 6 (สวพ.6) ตั้งอยู่่ที่จังหวัดจันทบุรี รับผิดชอบการปฏิบัติงานในพื้นที่ 7 จังหวัดในภาคตะวันออก ได้แก่ ฉะเชิงเทรา ปราจีนบุรี สระแก้ว ชลบุรี ระยอง จันทบุรี และตราด 
         ปัจจุบัน ได้เปลี่ยนชื่อหน่วยงานมาเป็น สำนักงานวิจัยและพัฒนาการเกษตร เขตที่ 6 ตามกฎกระทรวงแบ่งส่วนราชการกรมวิชาการเกษตร กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ พ.ศ. 2569 ลงวันที่ 22 กุมภาพันธ์ พ.ศ. 2569